Înaintea de decesul său, Rogachev i-ar fi trimis un mesaj SMS surorii sale și a rugat-o „să-i scrie soției sale, Yelena, deoarece se afla într-o stare proastă și nu gândea bine”.
Potrivit rapoartelor inițiale din presa rusă, Rogachev suferea de „o formă severă de cancer”, doar că aceste informații au fost negate de apropiații lui, susține canalului Telegram VCHK-OGPU.
De asemenea, rudele lui au insistat că nu există semne că Mikhail ar fi vrut să se sinucidă și că se afla într-o „dispoziție bună” cu puțin timp înainte de deces. Corpul său a fost descoperit în curtea apartamentului său de la etajul 10 de către un angajat al Serviciului Federal de Securitate (SVR). Agentul a spus că își plimba câinele atunci când a găsit corpul neînsuflețit al lui.